Bei 5–30 % der Patienten zeigt sich eine Immunreaktion. Dabei handelt es sich um eine mögliche Komplikation, die bei allen körperfremden Gewebespenden auftreten kann. Da die Hornhaut normalerweise über keine Blutgefäße verfügt, ist der Prozentsatz der Abstoßungen sehr gering. In der Regel werden Blutgruppen und Gewebearten bei Hornhauttransplantationen auch nicht berücksichtigt; die Übereinstimmung zwischen Spender und Empfänger ist keine Voraussetzung. Als Symptome einer Immunreaktion können ein anhaltendes Fremdkörpergefühl, Lichtempfindlichkeit, Rötungen oder Veränderungen des Seheindrucks auftreten.
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